Aunque los cuatro templos mayores de Rioseco comenzaron a construirse en un intervalos de sólo cincuenta años, la iglesia-convento de San Francisco fue la primera en construirse, y puede considerarse como el más antiguo. Que su construcción sólo durara 29 años (1491-1520), un portento para la época se explica por el patronazgo de las bien surtidas arcas de los Almirantes.

Del grandioso complejo conventual franciscano sólo quedan en pie la iglesia y un par de capillas. Exteriormente, ( Imagen ampliada, 44 K) es modesta en comparación con sus vecinas. Sus interiores, sin embargo, son una sucesión contínua de trabajos primorosos. Contraste por otra parte común a todas las edificaciones franciscanas.

Edificada según los cánones góticos, el templo trazado por Rodrigo de Astudillo es de una sóla nave (Imagen ampliada, 45 K) , con coro a sus pies, y ocho capillas laterales, cubiertas con crucería.

De su decoración interior destacan.

• Dos retablos platerescos de piedra, situados en la cabecera de la iglesia.
• Las estatuas orantes de doña Ana y doña Isabel de Cabrera, en el altar principal. Formaban parte del monumento funerario encargado para ellos por los fundadores.
• Las esculturas de los ángeles.
• Las pinturas de la cúpula ochavada.
• Dos tribunas de yeso de Jerónimo del Corral.
• Una estatua yacente de madera del doctor riosecano Bernardino Mena.